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科研進(jìn)展

水生所研究揭示生物結(jié)皮微生物群落碳循環(huán)機(jī)制

發(fā)表日期:2022-06-02王瓊,李華來(lái)源:水生生物研究所放大 縮小

  土壤有機(jī)碳是地球表層陸地生態(tài)系統(tǒng)最大的碳庫(kù),其動(dòng)態(tài)平衡不僅反映了生物群落組成和生態(tài)功能的變化,也深刻影響了生物圈溫室氣體的排放和氣候變化過(guò)程。在當(dāng)前全球溫室效應(yīng)日益顯著的背景下,土壤碳庫(kù)研究逐漸成為了生態(tài)學(xué)領(lǐng)域關(guān)注的重點(diǎn)。土壤微生物是驅(qū)動(dòng)土壤碳轉(zhuǎn)化的關(guān)鍵類(lèi)群,盡管宏組學(xué)技術(shù)可通過(guò)基因豐度來(lái)預(yù)測(cè)物質(zhì)循環(huán)過(guò)程,但受制于微生物生理狀態(tài)、土壤有機(jī)質(zhì)化學(xué)結(jié)構(gòu)類(lèi)型、有機(jī)碳氧化還原狀態(tài)差異等復(fù)雜因素的影響,在微生物群落水平上開(kāi)展土壤碳循環(huán)格局及過(guò)程的研究始終是一個(gè)難題。 

  在超過(guò)全球陸地面積40%的干旱區(qū),由藍(lán)藻、地衣、苔蘚等隱花植物支撐的生物結(jié)皮群落(Biocrusts)分布廣泛。它們不僅能防風(fēng)固沙、成土培肥,還能促進(jìn)荒漠生態(tài)系統(tǒng)生物群落的發(fā)育演替,其特征明顯的初生演替過(guò)程是利用宏組學(xué)手段開(kāi)展土壤生物群落研究的理想模式材料。中國(guó)科學(xué)院水生生物研究所胡春香研究員團(tuán)隊(duì)在前期多年研究工作基礎(chǔ)上,對(duì)典型野外樣地不同演替階段的生物結(jié)皮(藻結(jié)皮、藍(lán)藻地衣結(jié)皮、綠藻地衣結(jié)皮和蘚結(jié)皮)開(kāi)展了連續(xù)四年五批次的采樣調(diào)查工作,運(yùn)用多種宏基因組技術(shù)及大數(shù)據(jù)模型分析手段,結(jié)合生理層面的酶活性測(cè)定和環(huán)境因子關(guān)聯(lián)分析,揭示了生物結(jié)皮群落微生物碳循環(huán)格局及其互作和調(diào)節(jié)機(jī)理。相關(guān)研究成果以“Carbon cycle in the microbial ecosystems of biological soil crusts”為題,近日在線發(fā)表于學(xué)術(shù)期刊Soil Biology and BiochemistryDOI: 10.1016/j.soilbio.2022.108729)。 

  宏基因組的測(cè)序分析結(jié)果表明,耗能的光能驅(qū)動(dòng)的無(wú)機(jī)碳(Inorganic Carbon, IC)固定基因豐度較低,經(jīng)濟(jì)的化能驅(qū)動(dòng)的高分子有機(jī)碳降解、發(fā)酵、需氧呼吸和CO氧化基因較豐富。在有機(jī)碳的分解過(guò)程中,初期淀粉/糖原和纖維素的降解相關(guān)基因豐度更高,末期發(fā)酵相關(guān)基因的豐度更高。結(jié)合絕對(duì)定量的GeoChip分析及關(guān)鍵酶活性測(cè)定,發(fā)現(xiàn)在演替過(guò)程中無(wú)機(jī)碳固定、發(fā)酵、CH4氧化、淀粉/糖原和肽聚糖降解過(guò)程均呈下降趨勢(shì),多個(gè)高效的IC固定途徑及CO氧化和大多類(lèi)型的有機(jī)碳降解呈增加趨勢(shì)。共現(xiàn)分析進(jìn)一步表明,生物結(jié)皮生態(tài)系統(tǒng)中的碳循環(huán)由類(lèi)似于初級(jí)生產(chǎn)的同化模塊和類(lèi)似于次級(jí)生產(chǎn)的異化模塊組成;隨演替,循環(huán)途徑與微生物群落組成之間的關(guān)系發(fā)生著動(dòng)態(tài)變化,兩個(gè)模塊通過(guò)CBB循環(huán)、乙醇和丙酸發(fā)酵連接在一起,并被干旱度和鹽度平衡。以上研究結(jié)果深化了對(duì)生物結(jié)皮演替過(guò)程中碳循環(huán)途徑和調(diào)控機(jī)制的理解,并為深入揭示氣候變化條件下全球干旱區(qū)碳庫(kù)平衡動(dòng)態(tài)提供了研究基礎(chǔ)。 

  水生所王瓊博士為本論文第一作者、胡春香研究員為論文通訊作者,水生所張承才研究員、武漢理工大學(xué)張德祿教授參與了該項(xiàng)研究工作。該研究得到了國(guó)家自然科學(xué)基金(41877339)、中科院先導(dǎo)A項(xiàng)目(XDA17010502)及中科院特色研究所服務(wù)項(xiàng)目(Y85Z061601)的資助。

    文章鏈接:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0038071722001869 

1. 生物結(jié)皮群落中碳循環(huán)概念模型

2. 基于宏基因組測(cè)序的生物結(jié)皮的碳循環(huán);(aPCAPERMANOVA結(jié)果;(b)碳循環(huán)基因和途徑的相對(duì)豐度;右側(cè)分別為各無(wú)機(jī)碳固定(c)、CO氧化(d)、胞內(nèi)復(fù)雜有機(jī)碳的降解(e)、胞外復(fù)雜有機(jī)碳降解(f)以及各發(fā)酵(g)途徑的相對(duì)豐度;A、CG、M分別代表處于不同演替階段的四類(lèi)生物結(jié)皮

3. 基于GeoChip分析的關(guān)鍵基因或酶標(biāo)準(zhǔn)化平均信號(hào)強(qiáng)度;(a)無(wú)機(jī)碳固定、甲烷代謝以及CO氧化過(guò)程;(b)有機(jī)碳降解過(guò)程

4. 碳循環(huán)關(guān)鍵基因與屬水平高豐度微生物的共現(xiàn)性網(wǎng)絡(luò)

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