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科研進(jìn)展

武漢病毒所袁志明、夏菡/耶魯大學(xué)合作繪制埃及伊蚊中腸單細(xì)胞圖譜

發(fā)表日期:2024-06-06來(lái)源:武漢病毒研究所放大 縮小

伊蚊是登革病毒、黃熱病毒、基孔肯亞病毒等多種病毒的重要傳播媒介。蚊蟲中腸既是其消化血餐和吸收營(yíng)養(yǎng)的器官,還是病毒感染蚊蟲并復(fù)制增殖的初始靶器官,在蚊蟲傳播病毒和防御病毒中起雙重作用,是研究蚊蟲-病毒相互作用的重要模型。蚊蟲傳播病毒的關(guān)鍵因素之一是中腸細(xì)胞對(duì)病毒的易感性,而中腸細(xì)胞的異質(zhì)性會(huì)影響病毒的感染和復(fù)制,因此在單細(xì)胞水平研究蚊蟲感染傳播病毒的特征具有重要意義。但是目前針對(duì)埃及伊蚊仍缺乏可用的中腸單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組圖譜。

2024年6月6日,武漢病毒所袁志明、夏菡與耶魯大學(xué)醫(yī)學(xué)院崔穎俊合作在國(guó)際學(xué)術(shù)期刊Scientific Data在線發(fā)表了題為“A cell atlas of the adult female Aedes?aegypti midgut revealed by single-cell RNA sequencing”(《埃及伊蚊雌性成蚊中腸單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組圖譜》)的論文。

該研究選擇僅喂食葡萄糖水的7日齡成年雌性埃及伊蚊,解剖并收集其中腸,通過酶解離和密度梯度離心等方案制備成單細(xì)胞懸液并使用10x Genomics平臺(tái)進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(圖1),繪制了埃及伊蚊中腸單細(xì)胞圖譜。通過對(duì)單細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組特征進(jìn)行聚類注釋得到腸干細(xì)胞/腸母細(xì)胞(ISC/EB)、賁門細(xì)胞(Cardia)、腸上皮細(xì)胞(EC)、類腸上皮細(xì)胞(EC-like)、腸內(nèi)分泌細(xì)胞(EE)和內(nèi)臟肌細(xì)胞(VM) 等六類腸道細(xì)胞(圖2)。此外,還明確了不同類型細(xì)胞的標(biāo)記基因(圖2)。本研究將為進(jìn)一步在單細(xì)胞水平上解析蚊蟲感染和傳播病毒規(guī)律的研究奠定基礎(chǔ)。

武漢病毒所博士研究生汪順龍和博士后黃英為論文第一作者,袁志明研究員、夏菡青年研究員和耶魯大學(xué)醫(yī)學(xué)院崔穎俊副研究員為論文的通訊作者,海南大學(xué)教授韓謙為合作作者。該研究得到國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、國(guó)家自然科學(xué)基金等項(xiàng)目的資助。

圖1.埃及伊蚊中腸單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析流程。

圖2.埃及伊蚊中腸單細(xì)胞聚類與注釋。(a)不同類型中腸細(xì)胞的聚類;(b)不同類型中腸細(xì)胞數(shù)量占比;(c)不同類群中腸細(xì)胞的標(biāo)記基因。


文章鏈接:https://www.nature.com/articles/s41597-024-03432-8


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